Une clé pour ralentir la propagation du COVID-19 pourrait-elle être dans notre caca ? Potentiellement, oui. Des scientifiques à travers les États-Unis effectuent actuellement des tests sur les eaux usées des coronavirus : ils prélèvent des échantillons de déchets humains dans les stations d’épuration et les analysent pour détecter les particules virales. Si un nombre élevé d’échantillons fécaux sont positifs pour le virus dans une communauté spécifique, les responsables de la santé pourraient alors prendre des mesures locales pour aider à prévenir une épidémie.
La société Biobot, basée à Boston, qui se décrit comme «la première entreprise au monde à commercialiser des données sur les eaux usées», s’est associée à des chercheurs du MIT, de Harvard et du Brigham and Women’s Hospital pour lancer un programme pro bono qui cartographie COVID-19 à travers le pays. À ce jour, Biobot travaille avec environ 330 installations dans 40 États, ce qui représente environ 10 % de la population américaine.
La société a lancé son programme après que des études ont montré que le SRAS-CoV-2, le virus qui cause le COVID-19, est présent dans les matières fécales (les Centers for Disease Control and Prevention confirment que le virus a été trouvé dans les matières fécales de certains patients diagnostiqués avec le COVID-19), et se rassemble donc dans les égouts de la ville.
Alors que les chercheurs savent depuis les premiers stades de la nouvelle pandémie de coronavirus que l’agent pathogène est présent dans les matières fécales, l’objectif est maintenant de déterminer exactement sa quantité, pour donner une image plus claire des niveaux d’infection dans la population générale.
Selon Biobot, le nombre de personnes infectées par le COVID-19 pourrait être beaucoup plus élevé que ne le suggèrent les chiffres officiels. Données préliminaires, publiées sur le référentiel de prépublication medRxiv le 7 avril, a révélé que dans une grande région métropolitaine du Massachusetts avec 446 cas signalés, leur méthode basée sur les eaux usées a identifié jusqu’à 115 000 cas non signalés non connus des responsables de la santé.
«Nous commençons le processus en envoyant des kits d’échantillonnage aux installations participantes à travers les États-Unis. Ces usines de traitement sont chargées de collecter des échantillons composites de 24 heures et de les renvoyer à Biobot pour analyse », a déclaré Mariana Matus, PhD, PDG et co-fondatrice de Biobot. Santé. Au laboratoire, l’équipe Biobot traite les échantillons d’eaux usées, puis utilise une technique appelée protocole RT-PCR pour détecter le virus SARS-CoV-2. Les résultats des tests sont communiqués aux collectivités participantes via un rapport hebdomadaire.
« Là où le virus est détecté, nous fournirons une estimation de la prévalence de l’infection dans le bassin versant testé », explique le Dr Matus. « Le délai d’exécution des données est généralement de cinq jours. Il est très important pour notre équipe de récupérer les données analysées la semaine même où l’échantillon a été collecté, car la portée des données change si rapidement. »
Pendant ce temps, des chercheurs d’autres pays ont publié des résultats prometteurs de tests similaires. Une équipe à Paris a prélevé des échantillons d’eaux usées pendant plus d’un mois, observant une hausse et une baisse du SRAS-CoV-2 qui correspondaient à la forme de l’épidémie de COVID-19 dans la région (qui reste sous verrouillage). Les chercheurs ont déclaré que leur étude, publiée le medRxiv le 17 avril, a été le premier à montrer que le test peut détecter une forte augmentation des concentrations virales dans les eaux usées avant que des cas n’éclatent dans les établissements de santé.
« L’égout donne des épidémies en temps réel », a déclaré l’experte en santé publique Carol A. Winner, MPH, qui a dirigé plusieurs initiatives de santé communautaire financées par le gouvernement fédéral et fondé le mouvement Give Space en 2017. Santé. «Les matières fécales et l’urine sont constamment collectées pour être étudiées et bien que le coronavirus se dissipe rapidement, les scientifiques sont capables de trouver des particules microscopiques d’ARN du virus. Cela permet aux spécialistes de l’environnement de commencer à lier les niveaux d’épidémie aux niveaux échantillonnés dans les eaux usées.
En tant que moyen relativement bon marché et non invasif d’identifier et d’avertir contre de futures épidémies, les analyses des eaux usées pourraient fournir suffisamment d’informations pour guider les décisions sur les stratégies de protection et de prévention, telles que la distanciation sociale.
« Les données que nous trouvons permettent aux communautés locales et aux gouvernements de mesurer l’ampleur de l’épidémie et de prendre des mesures », explique le Dr Matus. « Comme nous trouvons constamment des résultats qui sont des ordres de grandeur supérieurs à ce qui a été testé cliniquement, même dans nos estimations les plus prudentes, nous apprenons qu’il existe une grande population asymptomatique ou peu symptomatique. »
Le Dr Matus pense que les tests sur les eaux usées devraient être utilisés parallèlement à d’autres méthodes de test pour aider à suivre l’efficacité des interventions entreprises et fournir des alertes précoces pour la réémergence du coronavirus, s’il a effectivement un cycle saisonnier.
« Les spécialistes de la santé peuvent utiliser ce type d’informations comme une autre pièce du puzzle pour prendre des décisions sur la prévention et la préparation », déclare Winner. « Si les écologistes détectent un pic de concentration du coronavirus dans le système d’égouts, cela signale la nécessité d’une distanciation sociale continue et d’une éventuelle mise en quarantaine et les alerte pour intensifier la préparation médicale. S’ils voient une baisse des concentrations, cela pourrait influencer positivement la cartographie de l’assouplissement des restrictions.
Jusqu’à ce que les données des analyses des eaux usées soient examinées par des pairs, la validité des informations n’est pas claire. Winner souligne également qu’il reste encore beaucoup à apprendre sur le nouveau coronavirus. « Cependant, la surveillance environnementale des systèmes d’égouts est en place et est constante, de sorte que la pratique technique elle-même offre un niveau de fiabilité », dit-elle.
Le Dr Matus pense que le potentiel de collecte de données sur les eaux usées est énorme. Biobot a développé des kits matériels qui peuvent collecter des échantillons directement à partir des conduites d’égout. « Nous travaillons à la mise à l’échelle de la technologie pour la rendre plus largement disponible », dit-elle. « Finalement, la possibilité de tester des lignes spécifiques ou à des points spécifiques dans les égouts nous aidera à identifier des populations spécifiques au sein d’une communauté plus large. »
Les informations contenues dans cette histoire sont exactes au moment de la presse. Cependant, comme la situation entourant la COVID-19 continue d’évoluer, il est possible que certaines données aient changé depuis leur publication. Alors que Health essaie de garder nos histoires aussi à jour que possible, nous encourageons également les lecteurs à rester informés des nouvelles et des recommandations pour leurs propres communautés en utilisant le CDC, l’OMS et leur service de santé publique local comme ressources.
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